При неэффективности или невозможности консервативного лечения одного из корней трехкорневого зуба положительный результат достигается хирургической стоматологией. Чтобы не удалять его из-за одного поврежденного корня, делают ампутацию корня – аккуратно выпиливают его и превращают трехкорневой зуб в двухкорневой при его полной функциональной активности. В случае когда кариес повреждает двухкорневой зуб в области бифуркации (место, где расходятся корни), применяют коронко-радикулярную сепарацию – распиливают коронку зуба на две части, тем самым разъединяя корни. В результате один двухкорневой зуб трансформируется в два однокорневых, что позволяет открыть доступ к больной полости и осуществить ее лечение.